Serapias orientalis’in mikorizal fungus çeşitliliği

View/ Open
Access
info:eu-repo/semantics/openAccessAttribution 3.0 United Stateshttp://creativecommons.org/licenses/by/3.0/us/Date
2020Metadata
Show full item recordCitation
Akın Mutlu, V , Şehi̇rli̇, H , Özdener Kömpe, Y . (2020). Serapias orientalis’in mikorizal fungus çeşitliliği . Artvin Çoruh Üniversitesi Orman Fakültesi Dergisi , 21 (2) , 301-309 . DOI: 10.17474/artvinofd.701282Abstract
Orkideler, yumrularının aşırı toplanması ve habitatlarının ciddi şekilde tahrip olması sonucu yok olma
tehdidi altındadır. Doğada orkidelerin korunması mikorizal fungus biyolojik çeşitliliğinin varlığına
bağlıdır. Bu çalışmada, Orta ve Doğu Karadeniz bölgesinde 4 ilin (Samsun, Ordu, Giresun, Trabzon)
sınırları içinde farklı habitatlardan toplanan Serapias orieantalis (Greuter ) Bauman H, Künkele
köklerindeki mikorizal fungusların moleküler tanımlaması yapılmıştır. Bitki kökleri 2015 bahar
aylarında toplanmış ve önce mikroskopta incelenerek mikorizal funguslar izole edilmiştir. Saflaştırılan
izolatlar, koloni özellikleri (koloni tipi, koloni rengi), hif yapısı (hif çapı ve dallanma yapısı) ve çekirdek
sayılarının belirlenmesi amacıyla PDA (patates dektroz agar) ortamında geliştirilmiştir. İzolatları
morfolojik özelliklerine göre gruplandırmak için küme analizi (UPGMA) yöntemi uygulanmış ve
kladogram oluşturulmuştur. Kümeleme analizine göre oluşturulan 3 grubun izolatlarını moleküler
düzeyde tanımlayabilmek için ITS-1 ve ITS-4 primerleri kullanılarak nüklear ribozomal DNA (rDNA)’nın
ITS1-5.8S-ITS2 gen bölgesi çoğaltılmıştır. DNA dizilimine dayanarak, 13 Rhizoctonia benzeri izolatın
Tulasnella cinsi ile 2 Rhizoctonia benzeri olmayan izolatın Fusarium oxysporum Schltdl. türü ile yakın
ilişkili olduğu bulunmuştur. Orchids are under a serious threat of extinction as a result of both excessive collecting and severe
destruction of their habitats. Studies conducted have shown that the protection of orchids depends on
the presence of mycorrhizal fungal biodiversity. In this study, molecular identification of mychorrhizal
fungi of Serapias orieantalis roots taken from different habitats within the borders of 4 provinces
(Samsun, Ordu, Giresun, Trabzon) in the Central and Eastern Black Sea region was conducted. Plant
roots were collected in the spring of 2015 and first examined under a microscope and then mycorrhizal
fungi were isolated. Purified isolates were developed in PDA (potato dectrose agar) medium in order
to determine colony characteristics (colony type, colony color), hif structure (hif diameter and
branching structure) and core numbers. Cluster analysis (UPGMA) method was applied to group the
isolates according to their morphological characteristics and a cladogram was created. Nuclear
ribozomal DNA (rDNA)’nın ITS 1-5.8S-ITS 2 gene region was amplified using ITS 1/ITS 4 primers in order
to identify isolates of 3 groups formed according to morphological data at the molecular level. Based
on the DNA sequence, 13 Rhizoctonia-like isolates were closely related to the Tulasnella genus, and 2
Rhizoctonia-unlike isolates were closely related to the Fusarium oxysporum.
Source
Artvin Çoruh Üniversitesi Orman Fakültesi DergisiVolume
21Issue
2Collections
The following license files are associated with this item: