Pathogenicity of different rhizobium radiobacter (agrobacterium tumefaciens) isolates and their identification with conventional methods
Künye
Tekiner, N. & Kotan, R. (2022). Pathogenicity of Different Rhizobium radiobacter (Agrobacterium tumefaciens) Isolates and Their Identification with Conventional Methods . Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi , Vol 25, Suppl 1 , 149-157 .Özet
Rhizobium radiobacter is a significant causal agent that ranks among
the top ten bacteria of molecular plant pathology in the world, has the
largest range of hosts among plant pathogenic bacteria, and limits
production and leads to economic losses in agriculture. The distinctive
feature of the causal agent from other bacteria is the Ti plasmid, the
extrachromosomal structure present in all virulent types. In this
study, virulence of five R. radiobacter isolates (1A, 1B, 2A, 2B and RK
473) isolated from different rootstocks was tested in carrot slices,
squash fruits, kalanchoe leaves, tomato and sunflower seedlings, and
GF677, M9 and MM106 rootstocks, and hypersensitive response tests
were conducted in tobacco plant. The isolates were diagnosed with
biochemical and physiological tests by classical methods. All isolates
formed tumors in carrot slices and squash fruits. 1A, 1B, 2A and 2B
isolates formed tumors in the stem of GF677 peach rootstock, while it
did not form any tumors on the stems of M9 and MM106 rootstocks.
Tumor formation was observed in 1B isolate in the root application of
GF677 peach rootstock, while no tumor formation was observed in
other isolates. RK 473 isolate became pathogenic in M9 and MM106
apple rootstocks, while it was observed that the other isolates did not
form any tumors. It was seen that none of the isolates became
pathogenic in tomato and sunflower root and stem, and kalanchoe leaf
applications. According to the virulence test results, 1B isolate was
found out to be the most virulent isolate. Biochemical and
physiological tests revealed the differences between isolates. Rhizobium radiobacter, dünyada moleküler bitki patolojisinde ilk on
bakteri içerisinde yer alan, bitki patojeni bakteriler içerisinde en geniş
konukçu dizisine sahip olan, fidan yetiştiriciliğinde üretimi sınırlayan
ve ekonomik kayıplara neden olan önemli bir hastalık etmenidir.
Etmeni diğer bakterilerden ayırıcı özelliği tüm virülent türlerinde
bulunan ekstrakromozomal yapı olan Ti plazmitidir. Bu çalışmada
farklı fidanlardan izole edilmiş beş R. radiobacter izolatının (1A, 1B,
2A, 2B ve RK 473) virülanslıkları havuç dilimi, kabak meyvesi,
kalonşe yaprağı, domates ve ayçiçeği fideleri, GF677, M9 ve MM106
anaçlarında test edilmiş ve tütün bitkisinde aşırı duyarlılık testi
yapılmıştır. İzolatların biyokimyasal ve fizyolojik testler ile klasik
yöntemlerle tanısı yapılmıştır. Tüm izolatlar havuç dilimi ve kabak
meyvesinde ur oluşturmuştur. 1A, 1B, 2A ve 2B izolatları GF677
şeftali anacının gövdesinde ur oluştururken, M9 ve MM106 elma
anaçlarının gövdesinde ur oluşturmamıştır. GF677 şeftali anacının
kök uygulamasında 1B izolatında ur oluşumu gözlemlenirken diğer
izolatlarda ur oluşumu gözlemlenememiştir. RK 473 izolatı M9 ve
MM106 elma anaçlarında patojen olurken, diğer izolatların ur
oluşturmadığı tespit edilmiştir. Tüm izolatların domates kök ve gövde, ayçiçeği gövde ve kalonşe yaprak uygulamalarında patojen
olmadıkları görülmüştür. Virülanslık test sonucunda 1B izolatı en
virülant izolat olarak belirlenmiştir. İzolatlar arasında biyokimyasal
ve fizyolojik test sonuçlarında farklılıklar bulunmuştur.