Pinus pinea l. (fıstık çamı)’de izoenzim analizi yardımıyla genetik yapının belirlenmesi
Yükleniyor...
Dosyalar
Tarih
2010
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Artvin Çoruh Üniversitesi
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
Bu çalışma, ülkemizde doğal olarak bulunan 5 çam türünden biri olan, Fıstıkçamı (Pinus pinea L.) populasyonlarındaki genetik varyasyonun ortaya koyulması amacıyla gerçekleştirilmiştir. Başta Ege ve Akdeniz olmak üzere Marmara Karadeniz bölgelerinde yayılışını yapan Fıstık çamının doğal meşcerelerinden seçilen 10 populasyondan elde edilen karışık tohum örnekleri, izoenzim analizine tabi tutulmuştur. Çalışılan enzim sistemleri LAP ve GOT olup, materyal olarak kuru tohumun haploid (?, n) olan endosperm dokusu kullanılmıştır. Her populasyon için 80 adet tohumun endospermi kullanılmıştır. Denemeye sokulan endosperm dokusundan (?, n) ekstrakte edilen çözülebilen enzim karışımları, “nişasta jeli zonal elektroforez” yardımıyla ayrılmış, histokimyasal boyama yöntemleri ile boyanarak enzimler (protein) bantlar halinde (zimogram) görünür hale getirilmiştir. Böylece, elde edilen izoenzim bantlarından hareketle allel frekansları % olarak hesaplanmış ve allel frekanslarına bağlı olarak da genetik mesafe belirlenmiştir. Araştırma sonucunda, LAP enzim sisteminde LAP-A ve LAP-B olmak üzere 2 aktif zonda (2 enzim gen lokusunda) 5 allel, GOT enzim sisteminde ise GOT-A, GOT-B ve GOT-C olmak üzere 3 enzim gen lokusunda 9 allel tipi tespit edilmiştir. Başka bir ifade ile 2 enzim sistemi ile çalışma sonucunda 5 enzim gen lokusunda toplam 14 allel tipi belirlenmiştir. Genel olarak GOT- sisteminde A2 ve C4 allelleri başat gözükmekte ve frekansları sıra ile 0.763-1.00 ve 0.38-1.00 arasında varyasyon göstermektedir. LAP- sisteminde ise A1 ve B2 allelleri başat olarak gözükmekte ve frekansları sıra ile 0.91-1.00 ve 0.85-1.00 arasında farklılık belirlenmiştir. Hesaplanan genetik mesafeler 0.02 ile 0.20 arasında değişiklik göstermektedir. Sonuç olarak, populasyonlar arasındaki farklılık ve benzerlikler ortaya konmuştur.
This research was conducted to determine the genetic variations of pinus pinea populations, one of the five pinus types endemic to our country. The mixed seed samples, picked from 10 different populations, were subjected to isoenzyme analysis. LAP and GOT are the the studied enyzme systems; haploid (?, n) endosperm tissue of a dry seed used as test material. 80 seed endosperm’s used for each population. The dissolvable enyzme blend that had been extracted from endosperm tissues, divided with the help of “starch gel regional electrophoresis”, painted with histochemical paints, enyzmes (protein) became visible as strips (zimogram).Thus, based on the enyzme strips we obtained, allele frequencies are calculated as percantage (%) and genetic distance is determined depending on allele frequency. As the result of the research, five allele types were located in two active zones (two enzyme gene locuses) in the LAP enzyme system; those zones being LAP-A and LAP-B, nine allele types were located in three enzyme gene locuses in the GOT enzyme system, those zones being GOT-A, GOT-B and GOT-C. In other words, after working on two enzyme systems, a total of 14 allele types were determined in five enzyme gene locuses. Generally, in GOT- system; A2 and C4 allele’s appear to be dominant and their frequency, in order, changes between 0.763-1.00 and 0.38-1.00. In LAP- system; A1 and B2 allele’s appear to be dominant and their frequency, in order, changes from 0.91-1.00 and 0.85-1.00. Calculated genetic distance differs between 0.02 to 0.20. To sum up, the similarities and the differences between populations had put forth.
This research was conducted to determine the genetic variations of pinus pinea populations, one of the five pinus types endemic to our country. The mixed seed samples, picked from 10 different populations, were subjected to isoenzyme analysis. LAP and GOT are the the studied enyzme systems; haploid (?, n) endosperm tissue of a dry seed used as test material. 80 seed endosperm’s used for each population. The dissolvable enyzme blend that had been extracted from endosperm tissues, divided with the help of “starch gel regional electrophoresis”, painted with histochemical paints, enyzmes (protein) became visible as strips (zimogram).Thus, based on the enyzme strips we obtained, allele frequencies are calculated as percantage (%) and genetic distance is determined depending on allele frequency. As the result of the research, five allele types were located in two active zones (two enzyme gene locuses) in the LAP enzyme system; those zones being LAP-A and LAP-B, nine allele types were located in three enzyme gene locuses in the GOT enzyme system, those zones being GOT-A, GOT-B and GOT-C. In other words, after working on two enzyme systems, a total of 14 allele types were determined in five enzyme gene locuses. Generally, in GOT- system; A2 and C4 allele’s appear to be dominant and their frequency, in order, changes between 0.763-1.00 and 0.38-1.00. In LAP- system; A1 and B2 allele’s appear to be dominant and their frequency, in order, changes from 0.91-1.00 and 0.85-1.00. Calculated genetic distance differs between 0.02 to 0.20. To sum up, the similarities and the differences between populations had put forth.
Açıklama
Anahtar Kelimeler
Allel, Endosperm, Genetik varyasyon, İzoenzim, Lokus, Pinus pinea L., Populasyon, Allelle, Endosperm, Genetic variation, Isoenyzme, Locus, Pinus pinea L., Population
Kaynak
III. Ulusal Karadeniz Ormancılık Kongresi Bildiriler Kitabı (Cilt 2)
WoS Q Değeri
Scopus Q Değeri
Cilt
2
Sayı
Künye
Yahyaoğlu, Z., Turna, İ. (2010). Pinus pinea l. (fıstık çamı)’de izoenzim analizi yardımıyla genetik yapının belirlenmesi, III. Ulusal Karadeniz Ormancılık Kongresi, Artvin, Türkiye, 20-22 Mayıs 2010, Cilt 2, 716-724
