Türkiye'de yayılış gösteren Arvicola amphibius'un (Mammalia: Rodentia) Orta Anadolu ve Doğu Anadolu'da yayılış gösteren populasyonlarının nükleer DNA (interphotoreceptor retinoid binding protein, IRBP) varyasyonları

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.advisorŞeker, Perinçek Seçkinozan
dc.contributor.authorBektaş, Derya Gökçe
dc.date.accessioned2025-02-04T20:54:24Z
dc.date.available2025-02-04T20:54:24Z
dc.date.issued2023
dc.departmentAÇÜ, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoloji Ana Bilim Dalıen_US
dc.descriptionFen Bilimleri Enstitüsü, Biyoloji Ana Bilim Dalıen_US
dc.description.abstractBu çalışmada, sucul habitatlarda yaşamaya uyum sağlamış bir kemirgen olan Arvicola amphibius'un Orta ve Doğu Anadolu'da yaşayan populasyonlarının nükleer DNA interphotoreceptor retinoid-binding protein (IRBP) gen dizilerindeki varyasyonlar belirlenerek populasyonlar arasındaki filogenetik ilişkiler ve genetik farklılıklar araştırıldı. IRBP gen bölgesi için toplam 12 özgün haplotip belirlendi. Neighbour-Joining (NJ), Maximum Likelihood (ML) ve network analizleri ile incelenen populasyonların Orta Anadolu ve Doğu Anadolu olmak üzere iki farklı coğrafik soy grubu oluşturduğu tespit edildi. IRBP gen dizilimi bakımından her iki coğrafik soy grubunu oluşturan populasyonlar arasında genetik farklılaşmanın yüksek düzeyde olduğu, gen akışının da düşük seviyede olduğu tespit edildi. Kimura 2-parametresi temel alınarak hesaplanan genetik uzaklık değeri, alttür ya da tür düzeyindeki genetik farklılaşmadan ziyade, soy grupları arasında tür içi varyasyon düzeyinde bir genetik farklılaşmanın olduğunu gösterdi. İki farklı coğrafik soy grubunun oluşmasındaki en önemli unsurun, soy grupları arasındaki gen akışını engelleyen Anadolu Diyagonali'ni oluşturan sıradağların olabileceği düşünülmektedir.
dc.description.abstractIn this study, phylogenetic relationships and genetic differences between populations were investigated by determining the variations in nuclear DNA interphotoreceptor retinoid-binding protein (IRBP) gene sequences of Arvicola amphibius, a rodent adapted to living in aquatic habitats, living in Central and Eastern Anatolia. A total of 12 specific haplotypes were determined for the IRBP gene region. It was determined that the populations examined by Neighbour-Joining (NJ), Maximum Likelihood (ML) and network analyses formed two different geographical lineages, namely Central Anatolia and East Anatolia. In terms of IRBP gene sequencing, it was determined that the genetic differentiation was at a high level and the gene flow was at a low level between the populations constituting both geographical lineage groups. The genetic distance value calculated according to the Kimura 2-parameter indicated that there was genetic variation at the intraspecific level of variation among lineages rather than at the subspecies or species level. It is believed that the most significant agent in the formation of two different geographical lineage groups may be the mountain ranges forming the Anatolian Diagonal, which prevents gene flow between lineage groups.
dc.identifier.endpage49en_US
dc.identifier.startpage1en_US
dc.identifier.urihttps://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=G_oJ1rKE4SgJUkomyAKpRxaPpTmWqIfCJmDlVK4YcgXCvX6OHHBVCB1rS5TNqlp5
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11494/5287
dc.identifier.yoktezid791310
dc.language.isotren_US
dc.publisherArtvin Çoruh Üniversitesien_US
dc.relation.publicationcategoryTezen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.snmzKA_20250204
dc.subjectZoolojien_US
dc.subjectZoologyen_US
dc.titleTürkiye'de yayılış gösteren Arvicola amphibius'un (Mammalia: Rodentia) Orta Anadolu ve Doğu Anadolu'da yayılış gösteren populasyonlarının nükleer DNA (interphotoreceptor retinoid binding protein, IRBP) varyasyonlarıen_US
dc.title.alternativeVariations of the nuclear DNA (interphotoreceptor retinoid binding protein, IRBP) in the populations of Arvicola amphibius(Mammalia: Rodentia) distrubuted in Central and East Anatolia living in Turkiyeen_US
dc.typeMaster Thesis

Dosyalar

Koleksiyon

Yüksek Lisans Tezleri