Türkiye'deki bazı etçil memeli türlerinin (Mammalia: Carnivora) DNA barkodlaması

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.advisorŞeker, Perinçek Seçkinozan
dc.contributor.authorÖzkurt, Aslı Yıldırım
dc.date.accessioned2025-02-04T20:54:26Z
dc.date.available2025-02-04T20:54:26Z
dc.date.issued2024
dc.departmentAÇÜ, Lisansüstü Eğitim Enstitüsü, Biyoloji Ana Bilim Dalıen_US
dc.descriptionLisansüstü Eğitim Enstitüsü, Biyoloji Ana Bilim Dalıen_US
dc.description.abstractBu tez çalışması kapsamında, Türkiye'de yaşayan bozayı (Ursus arctos), altın çakal (Canis aureus) ve kaya sansarı (Martes foina) olarak bilinen üç farklı karnivor memeli türünün DNA barkod bölgesi olarak bilinen mitokondriyal DNA'da bulunan sitokrom oksidaz c alt ünite I geni (COI) dizilendi. Elde edilen DNA dizileri, NCBI (National Center for Biotechnology Information) veritabanındaki BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) seçeneği kullanılarak, veritabanında mevcut olan diğer türlere ait diziler ile benzerlik bakımından (PI, pairwise identity, ikili benzerlik) karşılaştırıldı. Bunun yanı sıra, COI gen dizileri, Neighbour-Joining ve haplotip örgüsü olmak üzere, iki farklı filogenetik analiz yöntemine tabi tutuldu. BLAST sorgusu ve filogenetik analizler sonucunda, çalışılan türlere ait barkodlama bölgelerinin bu türler için taksonomik çalışmalarda karşılaşılan sorunların çözümü için faydalanılabilecek bir moleküler belirteç olabileceği kanısına varıldı.
dc.description.abstractWithin the scope of this study, the cytochrome oxidase c subunit I gene region (COI) of mitochondrial DNA, known as the DNA barcode region, of three different carnivorous mammal species living in Turkey, known as the brown bear (Ursus arctos), the golden jackal (Canis aureus) and the rock marten (Martes foina), was sequenced. The obtained DNA sequences were compared in terms of similarity (PI, pairwise identity, pairwise similarity) with the sequences of other species available in the database using the BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) option in the NCBI (National Center for Biotechnology Information) database. In addition, COI gene sequences were subjected to two different phylogenetic analysis methods: Neighbour-Joining and haplotype network. As a result of BLAST query and phylogenetic analyses, it was concluded that the barcoding regions of the studied species could be a molecular marker that can be used to clear the problems encountered in taxonomic studies for these species.
dc.identifier.endpage41en_US
dc.identifier.startpage1en_US
dc.identifier.urihttps://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=KMB79M3N7zK1UR2WYeRgQpUEgcUj23W-iW3GHFCtC5r_kPkkYxXUMkJ7uuqH-llG
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11494/5312
dc.identifier.yoktezid864589
dc.language.isotren_US
dc.publisherArtvin Çoruh Üniversitesien_US
dc.relation.publicationcategoryTezen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.snmzKA_20250204
dc.subjectBiyolojien_US
dc.subjectBiologyen_US
dc.titleTürkiye'deki bazı etçil memeli türlerinin (Mammalia: Carnivora) DNA barkodlamasıen_US
dc.title.alternativeDna barcoding of some carnivorous mammal species (Mammalia: Carnivora) in Turkeyen_US
dc.typeMaster Thesis

Dosyalar

Koleksiyon

Tez Koleksiyonu