Determination of biological control agent bacteria against crown gall
| dc.contributor.author | Tekiner Aydın, Nasibe | |
| dc.contributor.author | Kotan, Recep | |
| dc.date.accessioned | 2025-06-16T06:34:02Z | |
| dc.date.available | 2025-06-16T06:34:02Z | |
| dc.date.issued | 2025 | |
| dc.department | AÇÜ | |
| dc.description.abstract | This study was carried out to determine new bioagent bacteria for in vitro and semi-in vivo biological control of crown gall disease [Rhizobium radiobacter (Agrobacterium tumefaciens)]. A total of 2012 potential bioagent bacterial strains belonging to different genera were tested in vitro against the pathogen. Microbial identification systems (MIS) diagnoses of bioagent bacterial strains found to be effective as a result of in vitro tests were supported by some conventional tests. Then, the strains' semi-in vivo biocontrol activities found to be effective were tested in carrot slices and squash fruits. Statistical analysis of the data was made according to the percentage of surface coverage in carrot slices and the number and size of tumors in squash fruits. Then, the most effective bioagent and pathogenic bacterial strain diagnoses were determined molecularly. According to the results; 106 bioagent bacterial strains (66 antibiosis; 40 hyperparasitic effects) were found to be effective against R. radiobacter in vitro conditions. It was determined that conventional test results of bioagent bacteria and MIS results supported each other. As a result of semi-in vivo biocontrol activity, it was determined that 8 bioagent bacterial strains out of 106 bioagent bacterial strains did not produce pectolytic activity, and 8 bioagent bacterial strains could be evaluated as a result of semi-in vivo test. The most effective strain suppressing the development of the pathogen in carrot slices and squash fruits was RK 1986 (carrot slices 1.78±0.47; squash fruits 0.26±0.04), followed by RK 570A (carrot slices 2.89±0.82; squash fruits 0.35+0.03) and RK 1074 (carrot slices 3.44±0.99; squash fruits 0.46±0.05) strains were followed. According to the results of molecular identification, the most effective bioagent bacterial strain (RK 1986) was Bacillus mojavensis, and the pathogenic bacteria strain (1B) was R. radiobacter. | |
| dc.description.abstract | Bu çalışma kök kanseri hastalığının [Rhizobium radiobacter (Agrobacterium tumefaciens)] in vitro ve yarı in vivo testlerle biyolojik mücadelesine yönelik yeni biyoajan bakterilerinin belirlenmesi amacıyla yapılmıştır. Farklı cinslere ait toplam 2012 adet potansiyel biyoajan bakteri straini patojene karşı in vitro koşullarda test edilmiştir. In vitro test sonucu etkili bulunan biyoajan bakteri strainlerinin mikrobiyal identifikasyon sistem tanıları (MIS) bazı konvansiyonel testler ile desteklenmiştir. Daha sonra etkili bulunan izolatların yarı in vivo biyokontrol aktiviteleri havuç dilimi ve kabak meyvesinde test edilmiştir. Havuç dilimlerinde yüzey kaplama yüzdesi kullanılırken, kabak meyvesinde ise ur sayı ve büyüklüğüne göre veriler elde edilmiş ve istatistiki analizi yapılmıştır. Daha sonra en etkili bulunan biyoajan ve patojen bakteri strainlerinin tanıları moleküler olarak belirlenmiştir. Elde edilen bulgulara göre; R. radiobacter’e karşı in vitro koşullarda 106 adet biyoajan bakteri straini (66 adedi antibiyozis etki; 40 adedi hiperparazitik etki) etkili bulunmuştur. Biyoajan bakterilerin konvansiyonel tanı test sonuçları ile mikrobiyal identifikasyon tanı sonuçlarının birbirini destekler nitelikte olduğu belirlenmiştir. Yarı in vivo biyokontrol aktivite test sonucu 106 adet biyoajan bakteri straininden 8 adetinin pektolitik aktivite oluşturmadığı belirlenmiş ve yarı in vivo test sonucu 8 adet biyoajan bakteri straini değerlendirilebilmiştir. Havuç dilimi ve kabak meyvesinde patojenin gelişimini baskılayan en etkili strainin RK 1986 (havuç dilimi 1.78±0.47; kabak meyvesi 0.26±0.04) olduğu, onu RK 570A (havuç dilimi 2.89±0.82; kabak meyvesi 0.35±0.03) ve RK 1074 (havuç dilimi 3.44±0.99; kabak meyvesi 0.46±0.05) strainlerinin takip ettiği tespit edilmiştir. Moleküler tanı sonuçlarına göre en etkili olan biyoajan bakteri straini (RK 1986) Bacillus mojavensis, patojen bakteri strainin ise (1B) Rhizobium radiobacter olduğu kaydedilmiştir. | |
| dc.identifier.doi | 10.33462/jotaf.1364711 | |
| dc.identifier.endpage | 57 | |
| dc.identifier.issn | 13027050 | |
| dc.identifier.issue | 1 | |
| dc.identifier.scopus | 2-s2.0-85218232838 | |
| dc.identifier.scopusquality | Q3 | |
| dc.identifier.startpage | 46 | |
| dc.identifier.uri | https://hdl.handle.net/11494/5510 | |
| dc.identifier.volume | 22 | |
| dc.identifier.wos | WOS:001492359200002 | |
| dc.identifier.wosquality | Q3 | |
| dc.indekslendigikaynak | Scopus | |
| dc.indekslendigikaynak | Web of Science | |
| dc.indekslendigikaynak | TR-Dizin | |
| dc.institutionauthor | Tekiner Aydın, Nasibe | |
| dc.language.iso | en | |
| dc.publisher | Namik Kemal University - Agricultural Faculty | |
| dc.relation.ispartof | Journal of Tekirdag Agricultural Faculty | |
| dc.relation.publicationcategory | Makale - Uluslararası Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanı | |
| dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | |
| dc.subject | Agrobacterium tumefaciens | |
| dc.subject | Bacillus mojavensis | |
| dc.subject | Biological control | |
| dc.subject | Crown gall | |
| dc.subject | Rhizobium radiobacter | |
| dc.subject | Biyolojik mücadele | |
| dc.subject | Kök kanseri | |
| dc.title | Determination of biological control agent bacteria against crown gall | |
| dc.title.alternative | Kök kanserine karşı biyolojik mücadele ajanı bakterilerin belirlenmesi | |
| dc.type | Article |
